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virtual-patient
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图谱服务集成

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docker/生产环境服务部署文档.md
Unescape Escape View File

@ -161,7 +161,7 @@ mv virtual-patient-bucket-prod /data/vp/minio/data
# 验证镜像是否存在
docker images | grep virtual-patient-rasa-manager
# 运行容器
docker run --name virtual-patient-rasa-manager -p 8990:8890 -d virtual-patient-rasa-manager:1.0.0
docker run --name virtual-patient-rasa-manager -p 8990:8890 -v /data/vp:/data/vp -d virtual-patient-rasa-manager:1.0.0
# **启用网络环境服务，生产环境请使用**
docker run --name virtual-patient-rasa-manager -p 8990:8890 -v /data/vp:/data/vp --network virtual-patient-network -d virtual-patient-rasa-manager:1.0.0 --spring.profiles.active=prod
# 验证容器运行
@ -194,7 +194,7 @@ mv virtual-patient-bucket-prod /data/vp/minio/data
# 验证镜像是否存在
docker images | grep virtual-patient-web
# 运行容器
docker run --name virtual-patient-web -p 8899:8899 -d virtual-patient-web
docker run --name virtual-patient-web -p 8899:8899 -v /data/vp:/data/vp -d virtual-patient-web
# **启用网络环境服务，生产环境请使用**
docker run --name virtual-patient-web -p 8899:8899 -v /data/vp:/data/vp --network virtual-patient-network -d virtual-patient-web:1.0.0 --spring.profiles.active=prod
# 验证容器运行
@ -227,7 +227,7 @@ mv virtual-patient-bucket-prod /data/vp/minio/data
# 验证镜像是否存在
docker images | grep virtual-patient-manage
# 运行容器
docker run --name virtual-patient-manage -p 8891:8891 -d virtual-patient-manage:1.0.0
docker run --name virtual-patient-manage -p 8891:8891 -v /data/vp:/data/vp -d virtual-patient-manage:1.0.0
# **启用网络环境服务，生产环境请使用**
docker run --name virtual-patient-manage -p 8891:8891 -v /data/vp:/data/vp --network virtual-patient-network -d virtual-patient-manage:1.0.0 --spring.profiles.active=prod
# 验证容器运行
@ -260,7 +260,7 @@ mv virtual-patient-bucket-prod /data/vp/minio/data
# 验证镜像是否存在
docker images | grep virtual-patient-graph
# 运行容器
docker run --name virtual-patient-graph -p 8892:8892 -d virtual-patient-graph:1.0.0
docker run --name virtual-patient-graph -p 8892:8892 -v /data/vp:/data/vp -d virtual-patient-graph:1.0.0
# **启用网络环境服务，生产环境请使用**
docker run --name virtual-patient-graph -p 8892:8892 -v /data/vp:/data/vp --network virtual-patient-network -d virtual-patient-manage:1.0.0 --spring.profiles.active=prod
# 验证容器运行
@ -288,7 +288,7 @@ mv virtual-patient-bucket-prod /data/vp/minio/data
# 验证镜像是否存在
docker images | grep virtual-patient-nginx
# 运行容器
docker run --name virtual-patient-nginx -p 443:443 -d -e UPSTREAM_WEB_SERVERS={ip}:{port} -e UPSTREAM_MANAGE_SERVERS={ip}:{port} virtual-patient-nginx:1.0.0
docker run --name virtual-patient-nginx -p 443:443 -v /data/vp/dist:/usr/share/nginx/html/dist -d -e UPSTREAM_WEB_SERVERS={ip}:{port} -e UPSTREAM_MANAGE_SERVERS={ip}:{port} virtual-patient-nginx:1.0.0
# UPSTREAM_WEB_SERVERS:虚拟病人问诊系统服务的ip:port
# UPSTREAM_MANAGE_SERVERS:虚拟病人后端管理系统服务的ip:port

47
virtual-patient-graph/pom.xml
Unescape Escape View File

@ -20,6 +20,36 @@
<dependencies>
<dependency>
<groupId>com.alibaba.cloud</groupId>
<artifactId>spring-cloud-starter-alibaba-nacos-discovery</artifactId>
<exclusions>
<exclusion>
<groupId>com.alibaba</groupId>
<artifactId>fastjson</artifactId>
</exclusion>
<exclusion>
<groupId>com.alibaba.nacos</groupId>
<artifactId>nacos-common</artifactId>
</exclusion>
</exclusions>
</dependency>
<dependency>
<groupId>com.alibaba.nacos</groupId>
<artifactId>nacos-common</artifactId>
</dependency>
<dependency>
<groupId>org.springframework.cloud</groupId>
<artifactId>spring-cloud-starter-openfeign</artifactId>
</dependency>
<dependency>
<groupId>com.alibaba.cloud</groupId>
<artifactId>spring-cloud-starter-alibaba-nacos-config</artifactId>
</dependency>
<dependency>
<groupId>org.nebula-contrib</groupId>
<artifactId>ngbatis</artifactId>
@ -83,4 +113,21 @@
</dependencies>
<build>
<plugins>
<plugin>
<groupId>org.springframework.boot</groupId>
<artifactId>spring-boot-maven-plugin</artifactId>
<configuration>
<excludes>
<exclude>
<groupId>org.projectlombok</groupId>
<artifactId>lombok</artifactId>
</exclude>
</excludes>
</configuration>
</plugin>
</plugins>
</build>
</project>

2
virtual-patient-graph/src/main/java/com/supervision/VirtualPatientGraphApplication.java
Unescape Escape View File

@ -3,11 +3,13 @@ package com.supervision;
import org.mybatis.spring.annotation.MapperScan;
import org.springframework.boot.SpringApplication;
import org.springframework.boot.autoconfigure.SpringBootApplication;
import org.springframework.cloud.client.discovery.EnableDiscoveryClient;
import org.springframework.scheduling.annotation.EnableScheduling;
@EnableScheduling
@SpringBootApplication(scanBasePackages = {"com.supervision", "org.nebula"})
@MapperScan(basePackages = {"com.supervision.**.mapper"})
@EnableDiscoveryClient
public class VirtualPatientGraphApplication {
public static void main(String[] args) {

5
virtual-patient-graph/src/main/java/com/supervision/service/impl/GraphNebulaServiceImpl.java
Unescape Escape View File

@ -247,6 +247,11 @@ public class GraphNebulaServiceImpl implements GraphNebulaService {
@Override
public GraphVO queryGraph(String processId) {
Process process = Optional.ofNullable(processService.getById(processId)).orElseThrow(() -> new BusinessException("未找到对应的问诊流程"));
// 如果图谱ID为空,则创建图谱
if (StrUtil.isEmpty(process.getGraphId())) {
creatGraphByNebula(processId);
process = Optional.ofNullable(processService.getById(processId)).orElseThrow(() -> new BusinessException("未找到对应的问诊流程"));
}
List<NgSubgraph<String>> subgraphList = medicalRecDao.selectSubgraph(process.getGraphId());
List<NodeVO> nodeList = new ArrayList<>();

105
virtual-patient-graph/src/main/resources/application-dev.yml
Unescape Escape View File

@ -1,105 +0,0 @@
#服务器端口
server:
port: 8897
servlet:
context-path: /virtual-patient-graph
undertow:
# HTTP post内容的最大大小。当值为-1时，默认值为大小是无限的
max-http-post-size: -1
# 以下的配置会影响buffer,这些buffer会用于服务器连接的IO操作,有点类似netty的池化内存管理
# 每块buffer的空间大小,越小的空间被利用越充分
buffer-size: 512
# 是否分配的直接内存
direct-buffers: true
spring:
application:
name: virtual-patient-graph
servlet:
multipart:
max-file-size: 100MB
max-request-size: 100MB
##数据源配置
datasource:
type: com.alibaba.druid.pool.DruidDataSource
druid:
driver-class-name: com.mysql.cj.jdbc.Driver
url: jdbc:mysql://192.168.10.137:3306/virtual_patient?useUnicode=true&characterEncoding=utf-8&useSSL=true&nullCatalogMeansCurrent=true&serverTimezone=GMT%2B8
username: root
password: '123456'
initial-size: 5 # 初始化大小
min-idle: 10 # 最小连接数
max-active: 20 # 最大连接数
max-wait: 60000 # 获取连接时的最大等待时间
min-evictable-idle-time-millis: 300000 # 一个连接在池中最小生存的时间，单位是毫秒
time-between-eviction-runs-millis: 60000 # 多久才进行一次检测需要关闭的空闲连接，单位是毫秒
filters: stat,wall # 配置扩展插件：stat-监控统计，log4j-日志，wall-防火墙（防止SQL注入），去掉后，监控界面的sql无法统计
validation-query: SELECT 1 # 检测连接是否有效的 SQL语句，为空时以下三个配置均无效
test-on-borrow: true # 申请连接时执行validationQuery检测连接是否有效，默认true，开启后会降低性能
test-on-return: true # 归还连接时执行validationQuery检测连接是否有效，默认false，开启后会降低性能
test-while-idle: true # 申请连接时如果空闲时间大于timeBetweenEvictionRunsMillis，执行validationQuery检测连接是否有效，默认false，建议开启，不影响性能
stat-view-servlet:
enabled: false # 是否开启 StatViewServlet
filter:
stat:
enabled: true # 是否开启 FilterStat，默认true
log-slow-sql: true # 是否开启 慢SQL 记录，默认false
slow-sql-millis: 5000 # 慢 SQL 的标准，默认 3000，单位：毫秒
merge-sql: false # 合并多个连接池的监控数据，默认false
redis:
host: 192.168.10.138
port: 6379
password: 123456
nebula:
ngbatis:
use-session-pool: true
# 127.0.0.1:9669, ip:port, ....
hosts: 192.168.10.137:9669
username: root
password: 123456
# 注意,新建使用的时候,必须有一个库
space: virtual_patient
# http客户端使用
minConnSize: 5
maxConnSize: 10
timeout: 300000
idleTime: 180000
# ngbatis使用连接池配置
pool-config:
# 连接池中最小空闲连接数
min-conns-size: 0
# 连接池中最大空闲连接数
max-conns-size: 10
# 客户端同服务端建立连接的超时时间设置，单位为 ms；超过设定时间未建立起连接，则报错
timeout: 0
# 连接空闲时间，为 0 表示连接永不删除，单位为 ms
idle-time: 0
# 连接池检测空闲连接的时间间隔，为 -1 表示不进行检测
interval-idle: -1
# 连接等候时间，超过则不再等候连接
wait-time: 0
# 集群允许最小的服务可用率，1.0 表示为所有机器 graphd 可用，0.25 表示集群中 1/4 机器可用即可
min-cluster-health-rate: 1.0
# 是否允许 SSL 连接，目前暂不支持
enable-ssl: false
cql:
parser:
# 更换开发者自定义的 xml 所在位置
mapper-locations: nebulaMapper/**/*.xml # 默认为 mapper/**/*.xml
# nebula上传文件使用
path:
uploadFilePath: /opt/project/java/graphFile
importerPath: /data1/opt
mybatis-plus:
mapper-locations: classpath*:mapper/**/*.xml
configuration:
log-impl: org.apache.ibatis.logging.stdout.StdOutImpl
logging:
level:
org.nebula.contrib: DEBUG

49
virtual-patient-graph/src/main/resources/application.yml
Unescape Escape View File

@ -1,3 +1,48 @@
#服务器端口
server:
port: 8892
servlet:
context-path: /virtual-patient-graph
undertow:
# HTTP post内容的最大大小。当值为-1时，默认值为大小是无限的
max-http-post-size: -1
# 以下的配置会影响buffer,这些buffer会用于服务器连接的IO操作,有点类似netty的池化内存管理
# 每块buffer的空间大小,越小的空间被利用越充分
buffer-size: 512
# 是否分配的直接内存
direct-buffers: true
spring:
profiles:
active: dev
servlet:
multipart:
max-file-size: 100MB
max-request-size: 100MB
##数据源配置
datasource:
type: com.alibaba.druid.pool.DruidDataSource
druid:
initial-size: 5 # 初始化大小
min-idle: 10 # 最小连接数
max-active: 20 # 最大连接数
max-wait: 60000 # 获取连接时的最大等待时间
min-evictable-idle-time-millis: 300000 # 一个连接在池中最小生存的时间，单位是毫秒
time-between-eviction-runs-millis: 60000 # 多久才进行一次检测需要关闭的空闲连接，单位是毫秒
filters: stat,wall # 配置扩展插件：stat-监控统计，log4j-日志，wall-防火墙（防止SQL注入），去掉后，监控界面的sql无法统计
validation-query: SELECT 1 # 检测连接是否有效的 SQL语句，为空时以下三个配置均无效
test-on-borrow: true # 申请连接时执行validationQuery检测连接是否有效，默认true，开启后会降低性能
test-on-return: true # 归还连接时执行validationQuery检测连接是否有效，默认false，开启后会降低性能
test-while-idle: true # 申请连接时如果空闲时间大于timeBetweenEvictionRunsMillis，执行validationQuery检测连接是否有效，默认false，建议开启，不影响性能
stat-view-servlet:
enabled: false # 是否开启 StatViewServlet
filter:
stat:
enabled: true # 是否开启 FilterStat，默认true
log-slow-sql: true # 是否开启 慢SQL 记录，默认false
slow-sql-millis: 5000 # 慢 SQL 的标准，默认 3000，单位：毫秒
merge-sql: false # 合并多个连接池的监控数据，默认false
mybatis-plus:
mapper-locations: classpath*:mapper/**/*.xml
configuration:
log-impl: org.apache.ibatis.logging.stdout.StdOutImpl

10
virtual-patient-graph/src/main/resources/bootstrap-dev.yml
Unescape Escape View File

@ -0,0 +1,10 @@
spring:
cloud:
nacos:
config:
server-addr: 192.168.10.137:8848
file-extension: yml
namespace: b9eea377-79ec-4ba5-9cc2-354f7bd5181e
discovery:
server-addr: 192.168.10.137:8848
namespace: b9eea377-79ec-4ba5-9cc2-354f7bd5181e

10
virtual-patient-graph/src/main/resources/bootstrap-test.yml
Unescape Escape View File

@ -0,0 +1,10 @@
spring:
cloud:
nacos:
config:
server-addr: 192.168.10.137:8848
file-extension: yml
namespace: 88e1f674-1fbc-4021-9ff1-60b94ee13ef0
discovery:
server-addr: 192.168.10.137:8848
namespace: 88e1f674-1fbc-4021-9ff1-60b94ee13ef0

5
virtual-patient-graph/src/main/resources/bootstrap.yml
Unescape Escape View File

@ -0,0 +1,5 @@
spring:
profiles:
active: dev
application:
name: virtual-patient-graph

37
virtual-patient-graph/src/main/resources/logback-spring.xml
Unescape Escape View File

@ -0,0 +1,37 @@
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<configuration>
<include resource="org/springframework/boot/logging/logback/base.xml"/>
<logger name="org.springframework.web" level="INFO"/>
<!-- 开发环境 -->
<springProfile name="local,dev">
<logger name="org.springframework.web" level="INFO"/>
<logger name="org.springboot.sample" level="INFO"/>
<logger name="com.supervision" level="DEBUG"/>
<logger name="org.springframework.scheduling" level="INFO"/>
</springProfile>
<!-- 测试环境,生产环境 -->
<springProfile name="prod">
<logger name="org.springframework.web" level="INFO"/>
<logger name="org.springboot.sample" level="INFO"/>
<logger name="com.supervision" level="INFO"/>
<logger name="org.springframework.scheduling" level="INFO"/>
<root level="INFO">
<appender name="DAILY_LOG" class="ch.qos.logback.core.rolling.RollingFileAppender">
<!-- 服务器中当天的日志 -->
<file>/data/vp/log/virtual-patient-graph.log</file>
<rollingPolicy class="ch.qos.logback.core.rolling.TimeBasedRollingPolicy">
<!-- 服务器归档日志 -->
<fileNamePattern>/data/vp/log/history/virtual-patient-graph-%d{yyyy-MM-dd}.log</fileNamePattern>
</rollingPolicy>
<encoder>
<pattern>%date [%thread] %-5level %logger{35} - %msg%n</pattern>
</encoder>
</appender>
</root>
</springProfile>
</configuration>

BIN
virtual-patient-graph/src/main/resources/知识图谱test-1.xlsx
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